腸球菌屬革蘭氏陽性菌，可在人體寄生或在環境中長期存活。易受腸球菌感染的病人族群包括老年或體弱者、接受抗生素而使體內微生物菌叢改變患者，或上皮或黏膜屏障缺損患者等。腸球菌過去被認知為低毒性的病原，但近年來已成為醫療照顧相關感染的重要致病菌之一。常見引發的疾病包括導管相關血流感染、天然瓣膜或人工瓣膜心內膜炎、接受抗生素治療或導管置放患者泌尿道感染，及腹腔手術後腹腔內感染等。腸球菌也是社區泌尿道感染的病原菌之一。
腸球菌屬中，又以糞腸球菌(Enterococcus faecalis)及屎腸球菌(Enterococcus faecium)為主要致病菌種。近年來由於腸球菌抗藥性的增加，帶來臨床治療極大的挑戰。重要的抗藥性包含三大類: ampicillin 抗藥性、高濃度 aminoglycoside抗藥性，及vancomycin抗藥性，此三類藥物也是治療腸球菌感染症的主要藥物。